El principal problema al que se enfrentan los cilindros de 2 o 4 tiempos es el desgaste. Este es mucho mas prematuro en los motores de 2 tiempos, pero en ambos casos tiende a ovalizar la forma del alojamiento del piston. Esto es como consecuencia que, en el giro del cigüeñal y la consiguiente carrera del piston, las partes de este que mas rozan con el cilindro son las que estan encontradas en perpendicular al bulon. Esto lo propicia la inercia del conjunto, asi como el principio de acuñamiento que afecta a todos los pistones, y en especial a los mas cortos. Esta ovalizacion se mide comparando la distancia entre las paredes del cilindro en la direccion del bulon y en la perpendicular a esta. En caso de desgaste, la distancia en esta ultima direccion es siempre mayor, y la diferencia que muestra con la direccion del bulon es una pista del estado de uso de el motor.
Se realizan las mediciones en 3 alturas distintas A, B y C y en 2 ejes perpendiculares E y D entre si en cada una de ellas, como muestra la figura debajo.
Se utiliza para ello un alexometro F, como el representado en la figura, que tambien representa las ventanas V que hay que salvar en el caso del cilindro de 2 tiempos. Una vez medido de forma correcta el cilindro, los limites de servicio marcados por el fabricante indicaran la conveniencia u obligatoriedad de la sustitucion, o el rectificada a sobremedida en los casos que sea posible.
Otro desperfecto posible en el cilindro es su gripaje con el piston, del que ya se comentaron sus causas y su reparacion en el apartado del piston. Cuando la pared del cilindro no esta tratada, no resulta dificil la reparacion, pudiendo rectificarse un numero limitado de veces a sobremedida. Este numero lo delimita la cantidad de material de la camisa. Debemos tener en cuenta que, si se adelgaza muy esta camisa, el cilindro se deforma por no tener material suficiente que soporte las tensiones mecanicas y termicas. En casos de camisa postiza, la solucion suele consistir en su sustitucion. El verdadero problema surge con los cilindros tratados, que han de sustituirse al mas minimo contratiempo, pues, desaparecida la capa endurecida, queda al descubierto la aleacion ligera, con sus nulas propiedades resistentes a la erosion, aunque como ya se ha citado, hoy en dia es factible su reparacion.
Tambien resulta habitual encontrar ralladuras en las paredes del cilindro, que hacen perder compresion. Generalmente son ocasionadas por un desgaste excesivo de los segmentos, falta puntual de engrase (si fuese continua provocaria la destruccion inmediata de el motor] o aceite en malas condiciones, asi como por la presencia de particulas extrañas entre el cilindro y el piston, originadas generalmente por falta de mantenimiento en el filtro de aire.
Una averia comun a los 2 y 4 tiempos es el fallo de la junta de la base de cilindro, que se encarga del perfecto sellado de cilindro y carter, y posee consecuencias distintas cuando falla, segun cual sea su ciclo. En motores de 4 tiempos, el fallo de esta junta provoca perdidas de aceite, y su sustitucion generalmente es muy laboriosa. En motores de 2 tiempos, la averia es mucho mas grave, pues hace posible entradas no deseadas de aire que empobrecen en forma considerable la mezcla. Esto ultimo, en los casos de engrase separado supone una perdida de potencia y un sobrecalentamiento. Cuando mas peligroso resulta, es en los motores cuyo engrase se confia a la mezcla. El empobrecimiento provocado por las tomas de aire, supone una disminucion de la cantidad de aceite que llega a las paredes del cilindro, y el aumento de temperatura antes comentado no hace sino agravar el problema.
Un problema propio de las bancadas de cilindros dispuestos en linea, se basa en las deformaciones producidas por las diferentes condiciones de bajo a las que se enfrentan. Los cilindros exteriores no reciben calor por uno de sus lados, pero tampoco presentan la misma cantidad de material que se encargue de absorber las tensiones mecanicas y termicas producidas. Evitar esto obliga a disponer de bancadas suficientemente dimensionadas, y, en ocasiones, carburaciones distintas segun ta posicion.
